CERN Program Library - KobaWiki@RCNP
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softwares:cernlib [2016/12/25 08:09] – kobayashsoftwares:cernlib [2021/08/21 15:29] (現在) – kobayash
行 1: 行 1:
 ===== CERN Program Library ===== ===== CERN Program Library =====
 +==== CentOS 8.2.2004 ====
 +  * Debugging the DESY cernlib
 +    * PAW のメモリの大きさを変えた時は、すべてをコンパイルする必要はなく、以下のコマンドで再コンパイル可能。何度もコンパイルし直していると、log ファイルのファイル名が長くなりすぎてエラーになるので、ログファイルも消しておく。
 +
 +  $ emacs -nw 2005/src/pawlib/paw/paw/pawbig.inc
 +  $ touch 2005/src/pawlib/paw/programs/0pamain.F
 +  $ rm -rf 2005/build/log/*
 +  $ ./Install_cernlib_paw  
 +
 +    * コンパイルオプション (例えば #   define DefaultFCOptions) を 2005/src/config/linux-lp64.cf 内に追加したら、2005 ディレクトリ内の bin, build, lib ディレクトリをすべて消してすべてコンパイルし直しする。
 +
 +    * NWPAW を 175000000 以上にして、二次元ヒストグラムを表示すると、以下のように SIGFPE で落ちるときがある。これは再現性がある。
 +
 +  PAW> hi/pl 6
 +  
 +  Program received signal SIGFPE: Floating-point exception - erroneous arithmetic operation.
 +  
 +  Backtrace for this error:
 +  #0  0x7f7b6339216a
 +  #1  0x7f7b633912d3
 +  ...
 +  #32  0x7f7b627f96a2
 +  #33  0x429edd
 +  #34  0xffffffffffffffff
 +  Floating point exception (core dumped)
 +
 +    * gdb ~/cern/sandbox/cernlib_2005_minipacklib_paw/2005/bin/pawX11 として、 (dbg) run とすると、ighcxy_ () で落ちていることがわかる。コンパイル時に -g オプションをつけなくてもSIGであれば dbg がとらえてくれる。
 +    
 +==== Ubuntu 18.04 LTS ====
 +  * Ubuntu 18.04 に gfortran でコンパイルした cernlib をインストールした。ただ、うまく動いてないかも？
 +    - はじめに一応 Ubuntu のバージョンをチェックしておく。
 +
 +  $ cat /etc/lsb-release 
 +  DISTRIB_ID=Ubuntu
 +  DISTRIB_RELEASE=18.04
 +  DISTRIB_CODENAME=bionic
 +  DISTRIB_DESCRIPTION="Ubuntu 18.04.3 LTS"
 +
 +    - imake コマンドを使えるようにし、gmake から make へのリンクを貼る
 +
 +  $ sudo apt-get install xutils-dev
 +  $ sudo ln -s /usr/bin/make /usr/bin/gmake
 +
 +    - ディレクトリを作成
 +
 +  $ mkdir -p ~/cern/cernlib-2005-paw-128mb
 +  $ cd ~/cern/cernlib-2005-paw-128mb
 +
 +    - 以下のソースを [[https://www-zeuthen.desy.de/linear_collider/cernlib/new/cernlib_2005.html|CERNLIB 2005 and 2006 (64 bit) compatible with the gcc4/gfortran compiler suite]]からダウンロード。
 +      * [[https://www-zeuthen.desy.de/linear_collider/cernlib/new/cernlib-2005-all-new.tgz|cernlib-2005-all-new.tgz]]
 +      * [[https://www-zeuthen.desy.de/linear_collider/cernlib/new/cernlib.2005.corr.2014.04.17.tgz|cernlib.2005.corr.2014.04.17.tgz]]
 +      * [[https://www-zeuthen.desy.de/linear_collider/cernlib/new/cernlib.2005.install.2014.04.17.tgz|cernlib.2005.install.2014.04.17.tgz]]
 +
 +  $ wget https://www-zeuthen.desy.de/linear_collider/cernlib/new/cernlib-2005-all-new.tgz
 +  $ wget https://www-zeuthen.desy.de/linear_collider/cernlib/new/cernlib.2005.corr.2014.04.17.tgz
 +  $ wget https://www-zeuthen.desy.de/linear_collider/cernlib/new/cernlib.2005.install.2014.04.17.tgz
 +
 +    - tar ファイルの解凍と上書き
 +
 +  $ tar zxvf cernlib-2005-all-new.tgz
 +  $ mv cernlib.2005.corr.2014.04.17.tgz cernlib.2005.corr.tgz
 +  $ tar zxvf cernlib.2005.install.2014.04.17.tgz
 +
 +    - 中身があるか一応チェック
 +
 +  $ ls
 +  Install_cernlib* Install_old_patchy4*
 +  Install_cernlib_and_lapack* README_cernlib
 +  Install_cernlib_bin* cernlib-2005-all-new.tgz
 +  Install_cernlib_fixes* cernlib.2005.corr.tgz
 +  Install_cernlib_include* cernlib.2005.install.2014.04.17.tgz
 +  Install_cernlib_lib* cernlib.fixed*
 +  Install_cernlib_patchy* cernlib_2005.tgz
 +  Install_cernlib_src* cernlib_env*
 +  Install_cernlib_test* lapack.tar.gz
 +  Install_lapack* patchy4.tar.gz
 +  $ 
 +
 +    - src の展開
 +
 +  $ export CERN=$PWD
 +  $ ./Install_cernlib_src
 +
 +    - PAW のメモリを増加
 +
 +  $ emacs ~/cern/cernlib-2005-paw-128mb/2005/src/pawlib/paw/paw/pawbig.inc
 +  *** Edit Line 20 of the file as below ***
 +        PARAMETER (NWPAW=2000000)
 +               | | |
 +               V V V
 +  * NWPAW was enlarged from 2000000 to 32000000 by Nobu on Jul. 4, 2018
 +  *      PARAMETER (NWPAW=2000000)
 +        PARAMETER (NWPAW=32000000)
 +
 +    - sdf
 +
 +  $ emacs ~/cern/cernlib-2005-paw-128mb/2005/src/config/linux-lp64.cf
 +  *** Edit Line 142 and 157 as below ***
 +  ...
 +  # define DefaultCCOptions -fPIC 
 +                | | |
 +                V V V
 +  # define DefaultCCOptions /* -fPIC c/o by Nobu on Aug. 24, 2019*/
 +  ...
 +  #   define DefaultFCOptions -fno-automatic -fno-second-underscore -fPIC
 +                | | |
 +                V V V
 +  #   define DefaultFCOptions -fno-automatic -fno-second-underscore /* -fPIC c/o by Nobu on Aug. 24, 2019*/
 +  ...
 +
 +  $ emacs ~/cern/cernlib-2005-paw-128mb/2005/src/config/Imake.cf
 +  *** Edit Line 390 as below ***
 +  ...
 +  #if __GNUC__ == 4
 +            | | |
 +            V V V
 +  #if __GNUC__ == 7 
 +
 +    - Install_cernlib を書き換え
 +
 +  $ emacs ~/cern/cernlib-2005-paw-128mb/Install_cernlib
 +  *** Edit Line 13-15, and 33 as below ***
 +  ...
 +  echo "installing cernlib sources"
 +  
 +  ./Install_cernlib_src
 +                | | |
 +                V V V
 +  #echo "installing cernlib sources"
 +  #
 +  #./Install_cernlib_src
 +  ...
 +  [ "$GCCVSN" = "4" ]&&FC=gfortran
 +                | | |
 +                V V V
 +  [ "$GCCVSN" = "7" ]&&FC=gfortran
 +
 +    - インストールの実行
 +
 +  $ ./Install_cernlib
 +
 +
 ==== CentOS 7 ==== ==== CentOS 7 ====
  
行 7: 行 149:
   $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/scientific/6.8/x86_64/os/Packages/compat-gcc-34-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm   $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/scientific/6.8/x86_64/os/Packages/compat-gcc-34-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm
   $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/scientific/6.8/x86_64/os/Packages/compat-gcc-34-g77-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm   $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/scientific/6.8/x86_64/os/Packages/compat-gcc-34-g77-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm
-  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/cernlib-g77-2006-34.el6.x86_64.rpm +  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/Packages/c/cernlib-g77-2006-34.el6.x86_64.rpm 
-  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/cernlib-g77-devel-2006-34.el6.x86_64.rpm +  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/Packages/c/cernlib-g77-devel-2006-34.el6.x86_64.rpm 
-  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/cernlib-g77-static-2006-34.el6.x86_64.rpm +  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/Packages/c/cernlib-g77-static-2006-34.el6.x86_64.rpm 
-  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/cernlib-g77-utils-2006-34.el6.x86_64.rpm +  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/Packages/c/cernlib-g77-utils-2006-34.el6.x86_64.rpm 
-  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/paw-2006-34.el6.x86_64.rpm+  $ wget http://ftp.riken.jp/Linux/fedora/epel/6/x86_64/Packages/p/paw-2006-34.el6.x86_64.rpm
   $ su   $ su
 +  # yum remove compat-libf2c-34
   # yum localinstall compat-libf2c-34-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm   # yum localinstall compat-libf2c-34-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm
   # yum localinstall compat-gcc-34-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm   # yum localinstall compat-gcc-34-3.4.6-19.el6.x86_64.rpm
行 47: 行 190:
  
 ==== Shared Library ==== ==== Shared Library ====
- * CERN program library はそもそも shared library (lib***.so) をサポートしないらしい（参考: https://userweb.jlab.org/~marki/cernlib_on_debian/cernlib/faq.html#33)? [[http://cernlib.web.cern.ch/cernlib/version.html|公式ページ]]でも、武内さんのバイナリでも (http://ribf.riken.jp/~takesato/research/as/ap6.html)、static library　(lib***.a) しかない。+ * CERN program library はそもそも shared library (lib*.so) をサポートしないらしい（参考: https://userweb.jlab.org/~marki/cernlib_on_debian/cernlib/faq.html#33)? [[http://cernlib.web.cern.ch/cernlib/version.html|公式ページ]]でも、武内さんのバイナリでも (http://ribf.riken.jp/~takesato/research/as/ap6.html)、static library　(lib*.a) しかない。
  
softwares/cernlib.1482620978.txt.gz · 最終更新: 2016/12/25 08:09 by kobayash
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