Installation on Ubuntu MATE 22.04.02 LTS [KobaWiki@RCNP]

Installation on Ubuntu MATE 22.04.02 LTS

環境

本体: ThinkCenter M70q
- CPU: Intel(R) Core(TM) i5-10400T CPU @ 2.00GHz
- メモリ: 32 GB
OS: Ubuntu MATE 22.04.02 LTS

OS の準備

アカウント名は nestdaq にする。
- 以下のコマンドで作った。
```
$ sudo adduser nestdaq
... <Input information >... 
$ sudo usermod -aG sudo nestdaq
```
  nestdaq アカウントも sudo できるようにしておく（NestDAQ を動かすには root 権限はいらなかったと思うが、ネットワークの設定を見たりするときに必要）。
- その後、nestdaq でログインし直し。
Emacs インストール（もともと入っていた）。
```
$ sudo apt install emacs
```
RedisTimeSeries をmake する際、python3 が必要になる。自身の環境にはもともと入っていた。
Boost をインストールする前に FileSink で使用する zstd と libzstd-devを入れておく。さらに python3-dev を入れておきたいところだが、すでに入っていた。
```
$ sudo apt install zstd libzstd-dev
```
ZeroMQ を build する際、cmake が必要なので cmake をインストール（もともと入っていた）
```
$ sudo apt install cmake
$ cmake --version
cmake version ?.??.?
...
```
FairMQデバイスを複数立ち上げるため、tmux をインストールしておくとよい。
```
$ sudo apt install tmux
```

インストール

2023年10月1日(月)現在、NestDAQのインストール方法に関するドキュメントはいくつかある。本家の GitHub のリポジトリの以下のインストール方法が公式と思われるが、CMAKE_PREFIX_PATHの指定が不要なところもあり、新しめのインストール方法のメモを見るのが良さそう。
- https://github.com/spadi-alliance/nestdaq/blob/main/INSTALL.md
新しいインストール方法のメモとしては、e50server01 のインストールログを見るのが良い。
- https://docs.google.com/document/d/1LXQejEye76UJv8ahEP6n4tAMXi1fC9YXGf0zSLDs3NI/edit#
このページは、Raspberry Pi OS のインストールのページ（Installation on Raspberry Pi 4）をベースにした。Raspberry Pi OS は Debian 系の OS のため、Ubuntu と近い環境である。
SELinux は大抵問題を引き起こすので、切っておく。VNCServer などで問題が起きる。Ubuntu ではデフォルトで切れているようだ？
さらに、一般に、DAQの開発段階ではfirewall は切っておく。デフォルトでは切れているようだ？以下のように ufw をインストールして disable しても良いかもしれないが、そもそも ufw をインストールしなければ、firewall は有効にならないかも。
```
$ sudo apt install ufw
$ sudo ufw disable
```
参考: Step-by-Step Guide: Configuring a Firewall on Raspberry Pi https://raspberrytips.com/configure-firewall-raspberry-pi/

redis のインストール

git でソースをダウンロードしてコンパイル

$ mkdir -p /home/nestdaq/nestdaq/src
$ cd /home/nestdaq/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/redis/redis.git
$ cd redis
$ git checkout -b 6.0.16 6.0.16
$ time make -j10 PREFIX=$HOME/nestdaq
real	0m22.050s
user	1m41.892s
sys	0m6.858s
$ make PREFIX=$HOME/nestdaq install

設定ファイルを $HOME/nestdaq/etc にコピー

$ mkdir $HOME/nestdaq/etc
$ cp $HOME/nestdaq/src/redis/redis.conf $HOME/nestdaq/etc/

daemon mode をオンにする。

$ emacs -nw $HOME/nestdaq/etc/redis.conf
#daemonize no
daemonize yes

RedisTimeSeries をインストール

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone --recursive https://github.com/RedisTimeSeries/RedisTimeSeries.git
$ cd RedisTimeSeries
$ git checkout -b v1.4.9 v1.4.9
$ time make
...
real	0m2.577s
user	0m4.461s
sys	0m0.410s
$ mkdir $HOME/nestdaq/lib
$ cp $HOME/nestdaq/src/RedisTimeSeries/bin/linux-x64-release/redistimeseries.so $HOME/nestdaq/lib/

time make -j2 とすると、エラーとなる。

 $ time make -j2
make[1]: warning: -j0 forced in submake: resetting jobserver mode.
Submodule path 'deps/RedisModulesSDK': checked out 'c0740b8209abae38775adc6f3fefe05a520be55b'
Submodule path 'deps/readies': checked out '32e37e68f6ffa66f5a6e41cb37794147e84c38cb'
../deps/readies/mk/main:67: /home/nestdaq/nestdaq/src/RedisTimeSeries/deps/readies/mk/cfg: No such file or directory
make[1]: *** No rule to make target '/home/nestdaq/nestdaq/src/RedisTimeSeries/deps/readies/mk/cfg'.  Stop.
make: *** [Makefile:31: build] Error 2

Boot をインストール

Boost をダウンロードしてきてmake

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/boostorg/boost.git
$ cd boost
$ git checkout -b boost-1.80.0 boost-1.80.0
$ time git submodule update --init --recursive
...
real	3m42.531s
user	1m53.620s
sys	0m15.122s
$ time ./bootstrap.sh
...
real	0m16.048s
user	0m14.757s
sys	0m1.247s
$ time ./b2 install \
 link=static,shared \
 threading=single,multi \
 cxxstd=17 \
 variant=release,debug \
 --layout=tagged \
 -j10 \
 --prefix=$HOME/nestdaq
...
...updated 20451 targets...
real	10m38.834s
user	64m47.405s
sys	4m7.307s

ZeroMQをインストール

ZeroMQ を持ってきてコンパイル

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/zeromq/libzmq.git
$ cd libzmq
$ mkdir build
$ cmake \
 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/nestdaq \
 -DCMAKE_CXX_STANDARD=17 \
 -B ./build \
 -S .
$ cd build
$ time make -j10
...
real	0m17.104s
user	2m27.583s
sys	0m15.862s
$ make install

fmtlib をインストール

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/fmtlib/fmt.git
$ cd fmt
$ mkdir build
$ cmake \
 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/nestdaq \
 -DCMAKE_POSITION_INDEPENDENT_CODE=TRUE \
 -DCMAKE_CXX_STANDARD=17 \
 -B build \
 -S .
$ cd build
$ time make -j10
...
real	0m58.847s
user	5m26.186s
sys	0m8.569s
$ make install

FairLogger をインストール

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/FairRootGroup/FairLogger.git
$ cd FairLogger
$ mkdir build
$ cmake \
   -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/nestdaq \
   -DCMAKE_CXX_STANDARD=17 \
   -DUSE_EXTERNAL_FMT=OFF \
   -B build \
   -S .
$ cd build
$ time make -j10
...
real	0m16.190s
user	0m49.333s
sys	0m1.913s
$ make install

FairMQ をインストール (v1.4.55)

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/FairRootGroup/FairMQ.git
$ cd FairMQ
$ git checkout -b v1.4.55 v1.4.55
$ mkdir build
$ cmake \
   -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/nestdaq \
   -DCMAKE_CXX_STANDARD=17 \
   -DCMAKE_PREFIX_PATH="$HOME/nestdaq" \
   -B build \
   -S .
$ cd build
$ time make -j10
...
real	1m53.872s
user	11m53.531s
sys	0m30.784s
$ make install

hiredis のインストール (v1.1.0)

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/redis/hiredis.git
$ cd hiredis
$ time make PREFIX=$HOME/nestdaq install
...
real	0m1.641s
user	0m1.568s
sys	0m0.063s

redis-plus-plus のインストール (1.3.6)

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/sewenew/redis-plus-plus.git
$ cd redis-plus-plus
$ mkdir build
$ cmake \
    -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/nestdaq \
    -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release \
    -DCMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/nestdaq \
    -DREDIS_PLUS_PLUS_CXX_STANDARD=17 \
    -DREDIS_PLUS_PLUS_BUILD_TEST=OFF \
    -B ./build \
    -S .
$ cd build
$ time make -j10 install
...
real	0m7.923s
user	1m0.113s
sys	0m2.943s

nestdaq のインストール

$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/spadi-alliance/nestdaq.git
$ cd nestdaq
$ mkdir build
$ cmake \
    -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/nestdaq \
    -DCMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/nestdaq \
    -B ./build \
    -S .
$ cd build
$ time make -j10 install
...
real	0m23.572s
user	2m28.622s
sys	0m7.740s

redisinsight のインストール

$ cd $HOME/nestdaq/bin
$ wget https://downloads.redisinsight.redislabs.com/latest/redisinsight-linux64
$ chmod +x redisinsight-linux64
$ ./redisinsight-linux64
<なにも表示されなければOK。Ctrl-Cで殺す。殺したときはいろいろ言われる。>
$

スクリプトなどの設定

run ディレクトリ作成
```
$ mkdir $HOME/run
```

初期設定ファイル nestdaq.sh を /home/nestdaq/run に作成

$ cd $HOME/run
$ emacs nestdaq.sh

中身は以下。

#!/bin/bash
export NESTDAQ=$HOME/nestdaq
export PATH=$NESTDAQ/bin:$PATH

さらに、$HOME/.bashrc に以下の行を追記。

# For NestDAQ 2023.10.02                                                       
source $HOME/run/nestdaq.sh

redis の立ち上げのためのファイル作成

$ cd $HOME/run
$ emacs init.sh

中身は以下。

#!/bin/bash
redis-server $NESTDAQ/etc/redis.conf --loadmodule $NESTDAQ/lib/redistimeseries.so
#RIHOST=0.0.0.0 redisinsight-linux64 &
#daq-webctl >& $NESTDAQ/log/daq-webctl.log &
daq-webctl >& /dev/null &

さらに、実行権限を付与

$ chmod +x ./init.sh

NestDAQ起動のためのスクリプトをコピー
```
$ cd $HOME/run
$ cp $HOME/nestdaq/scripts/*.sh ./
```

動かしてみる

run ディレクトリに移動
```
 cd $HOME/run
```
.bashrcをソースし、init.sh を実行する。
```
$ source $HOME/.bashrc
$ ./init.sh
```
もし間違って ./init.sh を複数回実行した場合、redis と daq-webctl のプロセスを殺す。プロセスの殺し方は色々あるが、
```
$ killall redis-server
$ killall daq-webctl
```
とすれば、全部殺せる。このようなスクリプトを用意しておいても良いかも。または、init.sh を編集し、すでにプロセスが立ち上がっていたら新たに立ち上げないとか、既存のプロセスを殺してから立ち上げるとか、賢い感じに編集しても良い。
これで Firefox などのブラウザを立ち上げ、http://localhost:8080/にアクセス
web ブラウザ上で、任意の Run Number を入力。初回起動時は最新のランナンバーがないと言われるが、それが正しい。
tmux を立ち上げ、ウィンドウを分割。Ctl-b “ で上下方向分割、Ctl-b % で左右方向分割。ウィンドウ間の移動は Ctl-b o。emacs のショートカットに近いものに設定しても良い。

tmux 上で 3 分割くらいにして、以下のスクリプトを実行。

---------------------------------------
$ ./topology-1-1.sh
...
---------------------------------------
$ ./start_device.sh Sampler
...
---------------------------------------
$ ./start_device.sh Sink
...
---------------------------------------

この状態で、DAQ Controller から、Initialize, Reset Task, Run とボタンを押すと、DAQがスタートする。
tmux の端末では、メッセージが流れているはず。データが流れていれば、In や Out のデータ転送レートが 0 以外になる。
DAQをストップする場合は、 Stop ボタンを押す。

nestdaq-user-impl のインストール

まず、比較的新しい ROOT をインストールする必要があった。バイナリからをインストールするには、以下の手順をふむ。
手元のパソコンに root_v6.28.06.Linux-centos8-x86_64-gcc8.5.tar.gz をダウンロード。
```
$ 
$ wget https://root.cern/download/root_v6.28.06.Linux-centos8-x86_64-gcc8.5.tar.gz
```

ファイルを /home/kobayash/local/root_v ディレクトリにダウンロードして解凍。

$ mkdir $HOME/local
$ cd $HOME/local
$ wget https://root.cern/download/root_v6.28.06.Linux-centos8-x86_64-gcc8.5.tar.gz
$ tar zxvf root_v6.28.06.Linux-ubuntu22-x86_64-gcc11.4.tar.gz

$HOME/.bashrc を編集し、ROOTの設定を行う。

# For root 2023.10.02
source $HOME/local/root/bin/thisroot.sh

試しにroot を実行。

$ source $HOME/.bashrc
$ root
root
   ------------------------------------------------------------------
  | Welcome to ROOT 6.28/06                        https://root.cern |
  | ...                                                              |
   ------------------------------------------------------------------

root [0] TF1 * f = new TF1("f","sin(x)",0,10)
(TF1 *) 0x55bf8ff68140
root [1] f->Draw()
Info in <TCanvas::MakeDefCanvas>:  created default TCanvas with name c1
 <sin カーブが書かれる。>
root [2] .q

nestdaq-user-impl をコンパイル。
```
$ cd $HOME/nestdaq/src
$ git clone https://github.com/spadi-alliance/nestdaq-user-impl.git
$ cd nestdaq-user-impl
$ mkdir build
$ cmake \
    -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/nestdaq \
    -DCMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/nestdaq \
    -B ./build \
    -S .
$ cd build
$ time make -j10 install
...
```
ただし、これをすると /home/nestdaq/nestdaq/bin 内の nestdaq のインストール時に作られた実行形式ファイル Sampler や Sink が上書きされる。nestdaq の実行形式ファイルと nestdaq-user-impl の実行形式ファイルを別々に扱うには、インストール場所を変えるなどの対策が必要 (-DCMAKE_INSTALL_PREFIX を変えるとか)。

nestdaq-user-impl (TFBFilePlayer - fltcoin - tfdump) の実行

五十嵐さんの以下のドキュメントを参考に、Data Replayer を動かしてみる。
- Data replayer の動かし方: https://docs.google.com/document/d/1oBinmPbCu2nJ7lIiAZuBauSBQh_Zdi8SVdp4Hsh-2Wo/edit?pli=1#

$ cd $HOME/run
$ wget http://www-online.kek.jp/~igarashi/nestdaq/run000408_00_stf.dat.gz
$ wget http://www-online.kek.jp/~igarashi/nestdaq/run000410.dat.gz
$ wget http://www-online.kek.jp/~igarashi/nestdaq/topo_player.sh
$ gunzip run000408_00_stf.dat.gz
$ gunzip run000410.dat.gz
$ ls
... run000408_00_stf.dat  run000410.dat ...

redis-server と daq-webctl が立ち上がっているか ps コマンドで確認。立ち上がっていなかったら、init.sh を実行。
```
$ ps aux | grep redis
$ ps aux | grep daq-webctl
$ ./init.sh
```
五十嵐さんの topo_player.sh を実行。
```
$ chmod +x topo_plauer.sh
$ ./topo_player.sh
```
/hoem/nestdaq/run ディレクトリで tmux を立ち上げ、４分割 (Ctrl-b % と Ctrl-b ” を使う。パネル移動は Ctrl-b o。)し、FairMQ デバイスを立ち上げる。
```
<パネル 1>
$ ./start_device.sh TFBFilePlayer --in-file run000410.dat
<パネル 2>
$ ./start_device.sh fltcoin
<パネル 3>
$ ./start_device.sh tfdump
```
web ブラウザを立ち上げ、 http://localhost:8080 にアクセスしする。
RUN number の New value: に任意の数字を入力し、 [ Send ] ボタンを押す。
[Init Device and Connection] > [ Init Task ] > [ Run ] ボタンを順次押すと、実行される。
DAQ のストップは [ Stop ] ボタンを押す。DAQ を終了する場合は、さらに [ Reset Task ], [ Reset Device ] を押す。
FairMQデバイスも終了する場合は [ End ] ボタンを押す。

nestdaq-user-impl (STFBplayer - FileSink/Scaler) の実行

まず、topology_stbplayer_scr.sh を作成。

#!/bin/bash

#host=127.0.0.1
#port=6379
#db=0
server=redis://127.0.0.1:6379/0

#function config_endpoint () {
function endpoint () {
  # Usage: 
  #   config_endpoint "service" "channel" "parameters"
  
  echo redis-cli -u $server hset daq_service:topology:endpoint:$1:$2 ${@:3}  
  $NESTDAQ/bin/redis-cli -u $server hset daq_service:topology:endpoint:$1:$2 ${@:3}  
}

#function config_link () {
function link () {
  # config_link "service1" "channel" "service2" "channel" "parameters"
  
  echo redis-cli -u $server set daq_service:topology:link:$1:$2,$3:$4 non
  $NESTDAQ/bin/redis-cli -u $server set daq_service:topology:link:$1:$2,$3:$4 none
}


echo "---------------------------------------------------------------------"
echo " config endpoint (socket)"
echo "---------------------------------------------------------------------"
#---------------------------------------------------------------------------
#         service           channel       options
#---------------------------------------------------------------------------

endpoint  STFBFilePlayer    out           type push  method connect 
endpoint  STFBFilePlayer    dqm           type push  method connect 

endpoint  Scaler            in            type pull  method bind
endpoint  Scaler            out           type push  method connect

endpoint  FileSink          in            type pull  method bind
endpoint  ScrSink           in            type pull  method bind

echo "---------------------------------------------------------------------"
echo " config link"
echo "---------------------------------------------------------------------"
#---------------------------------------------------------------------------
#         service1          channel1       service2          channel2      
#---------------------------------------------------------------------------

link      STFBFilePlayer    out            FileSink in
link      STFBFilePlayer    dqm            Scaler   in
link      Scaler            out            ScrSink  in

mq_param_stbplayer_scr.sh を作成。

#!/bin/bash

server=redis://127.0.0.1:6379/2

function param () {
  # "instance":"field" "value"
  #echo redis-cli -u $server set parameters:$1:$2 ${@:3}
  #redis-cli -u $server set parameters:$1:$2 ${@:3}
  echo redis-cli -u $server hset parameters:$1 ${@:2}
  redis-cli -u $server hset parameters:$1 ${@:2}
}

#==============================================================================
#      isntance-id       field  value    field value   field          value
param FileSink-0 multipart true openmode create prefix data ext .dat
param ScrSink-0 multipart true openmode create prefix scrdata ext .dat
param Scaler-0 num-source 1 prefix scr ext .dat

start_device.sh を編集し、以下のように、DQM_URI を追加。

#!/bin/bash

#MY_TERM=xterm

DAQSERVICE_URI=' --registry-uri tcp://127.0.0.1:6379/0'
METRICS_URI=' --metrics-uri tcp://127.0.0.1:6379/1'
CONFIG_URI=' --parameter-config-uri tcp://127.0.0.1:6379/2'
DQM_URI=' --dqm-uri tcp://127.0.0.1:6379/3'

#---------------------------------------------------------
if [[ $1 =~ fairmq- ]]; then
  BINDIR=""
else 
  BINDIR=/home/nestdaq/nestdaq/bin
fi

PLUGIN_LIBDIR=/home/nestdaq/nestdaq/lib

PLUGIN_SEARCH_PATH=" -S '<$PLUGIN_LIBDIR'"
DAQSERVICE_PLUGIN=" -P daq_service"
METRICS_PLUGIN=" -P metrics"
CONFIG_PLUGIN=" -P parameter_config"

echo "BINDIR             = $BINDIR"
echo "PLUGIN_LIBDIR      = $PLUGIN_LIBDIR"
echo "PLUGIN_SEARCH_PATH = $PLUGIN_SEARCH_PATH"
echo "DAQSERVICE_PLUGIN  = $DAQSERVICE_PLUGIN"
echo "METRICS_PLUGIN     = $METRICS_PLUGIN"
echo "CONFIG_PLUGIN      = $CONFIG_PLUGIN"
echo "DAQSERVICE_URI     = $DAQSERVICE_URI"
echo "METRICS_URI        = $METRICS_URI"
echo "CONFIG_URI         = $CONFIG_URI"
echo "DQM_URI            = $DQM_URI"

#==============================================================================
function run_device () {
  local var;
  var+=$PLUGIN_SEARCH_PATH
  var+=$DAQSERVICE_PLUGIN
  var+=$METRICS_PLUGIN
  var+=$CONFIG_PLUGIN
  var+=$DAQSERVICE_URI
  var+=$METRICS_URI
  var+=$CONFIG_URI
  var+=$DQM_URI
  var+=" --severity debug4"

  if [ -n "$MY_TERM" ]; then
    #echo \
    $MY_TERM -title $1 -e "$BINDIR/$@ $var"
  else
    #echo \
    eval "$BINDIR/$@ $var"
  fi
}

run_device $@

~~さらに、start_device.sh をコピーし、start_device_scr.sh をつくり、function run_device () の中のvar に var+=“–service-name ScrSink” という行を追加。~~(2024/1/19 start_device.sh 実行時に –service-name ScrSink オプションをつければ良いことがわかったので、この作業削除。)

topology_stbplayer_scr.sh, mq_param_stbplayer_scr.sh を実行。

$ chmod +x topology_stbplayer_scr.sh
$ chmod +x mq_param_stbplayer_scr.sh
$ chmod +x start_device_scr.sh
$ ./topology_stbplayer_scr.sh
$ ./mq_param_stbplayer_scr.sh

ファイルを保存する場所を作成。
```
$ mkdir scr scrdata data
```
/hoemnestdaq/run ディレクトリで tmux を立ち上げ、４分割 (Ctrl-b % と Ctrl-b “ を使う。パネル移動は Ctrl-b o。)し、FairMQ デバイスを立ち上げる。
```
<パネル 1>
$ ./start_device.sh STFBFilePlayer --wait 1000 --in-file run000408_00_stf.dat
<パネル 2>
$ ./start_device.sh Scaler
<パネル 3>
$ ./start_device.sh FileSink --service-name ScrSink
<パネル 4>
$ ./start_device.sh FileSink
```
ちなみに、STFBFilePlayer –wait 1000 は 1000 ms wait している。wait がないと一瞬でファイルを読んでしまう。ただし、mq_param.sh で STFBFilePlayer-0 に wait を設定していると、それで上書きされる。実行時のオプションより redis のパラメータの方が優先されるので注意。redis をクリアする必要あり。
web ブラウザを立ち上げ、 http://localhost:8080 にアクセスしする。
RUN number の New value: に任意の数字を入力し、 [ Send ] ボタンを押す。
[Init Device and Connection] > [ Init Task ] > [ Run ] ボタンを順次押すと、実行される。
DAQ のストップは [ Stop ] ボタンを押す。DAQ を終了する場合は、さらに [ Reset Task ], [ Reset Device ] を押す。
FairMQデバイスも終了する場合は [ End ] ボタンを押す。

SlowDash のインストール

SlowDash の20230608 版をダウンロード: https://www.rcnp.osaka-u.ac.jp/mattermost/spadi-alliance/pl/e57nuxyswpg8irahb1fh5mz9ca
解説はこちら: https://www.rcnp.osaka-u.ac.jp/mattermost/spadi-alliance/pl/k64keksqxty9fgr7drpy9w4zze

ダウンロードした SlowDash-230608.tgz を /home/nestdaq/nestdaq/src/ にコピーし、解凍。

$ cp $HOME/Downloads/SlowDash-230608.tgz $HOME/nestdaq/src/
$ cd $HOME/nestdaq/src
$ tar zxvf SlowDash-230608.tgz

SlowDash-230608/system ディレクトリに行き、make する。
```
$ cd $HOME/nestdaq/src/SlowDash-230608/system/
$ make
```

試しに実行してみる。

$ source /home/nestdaq/nestdaq/src/SlowDash-230608/bin/slowdash-bashrc
$ slowdash --port=18881
<Ctrl-c で終了。>

毎回 source コマンドを実行するのは面倒なので、PATH を .bashrc で設定する。以下の行を /home/nestdaq/.bashrc に追記。
```
# For SlowDash 2023.10.02
export PATH=${PATH}:${HOME}/nestdaq/src/SlowDash-230608/bin
```

SlowDash で Scalerから Redis に投げたヒストグラムなどを表示する

SlowDash の Project 用のディレクトリを作成

$ mkdir $HOME/nestdaq/src/SlowDash-230608/Projects/Test_Redis_Histo
$ cd $HOME/nestdaq/src/SlowDash-230608/Projects/Test_Redis_Histo

SlowDash の SlowdashProject.yaml ファイルを作成

slowdash_project:
  name: RedisTest
  title: Redis Test, Simple version

  data_source:
    type: Redis
    parameters:
      url: redis://localhost:6379/
      time_series: {db: 1}
      object: { db: 3 }

ここに移動し、試しに起動。ただ、起動前に python3 のredis パッケージが必要だった。
```
$ pip3 install redis
$ slowdash --port=18881
```
web ブラウザで http://localhost:18881 にアクセス。

メモ

Raspberry Pi で FairMQ を make するとき、atomic ライブラリのリンクでエラーとなっていたが、Ubuntuではエラーにならない。Raspberry Pi では cmake コマンドのオプションに -DCMAKE_CXX_LINK_FLAGS=”-Wl,–no-as-needed -latomic“としていたが、Ubuntuでは必要なかった。atomic はデフォルトでリンクされるようだ？

nestdaq-user-impl make 時のエラー。

[ 34%] Linking CXX executable FileSink
/usr/bin/ld: CMakeFiles/FileSink.dir/FileSink.cxx.o: warning: relocation against `_ZN5boost9iostreams5bzip210stream_endE' in read-only section `.text._ZN5boost9iostreams16symmetric_filterINS0_6detail21bzip2_compressor_implISaIcEEES4_E5closeINS0_20non_blocking_adapterINS2_16linked_streambufIcSt11char_traitsIcEEEEEEEvRT_St13_Ios_Openmode[_ZN5boost9iostreams16symmetric_filterINS0_6detail21bzip2_compressor_implISaIcEEES4_E5closeINS0_20non_blocking_adapterINS2_16linked_streambufIcSt11char_traitsIcEEEEEEEvRT_St13_Ios_Openmode]'
/usr/bin/ld: CMakeFiles/FileSink.dir/FileSink.cxx.o: in function `boost::detail::sp_counted_impl_p<boost::iostreams::symmetric_filter<boost::iostreams::detail::bzip2_compressor_impl<std::allocator<char> >, std::allocator<char> >::impl>::dispose()':
FileSink.cxx:
...
/usr/bin/ld: CMakeFiles/FileSink.dir/FileSink.cxx.o: in function `void boost::iostreams::detail::close_all<boost::iostreams::basic_bzip2_compressor<std::allocator<char> >, boost::iostreams::detail::linked_streambuf<char, std::char_traits<char> > >(boost::iostreams::basic_bzip2_compressor<std::allocator<char> >&, boost::iostreams::detail::linked_streambuf<char, std::char_traits<char> >&)':
FileSink.cxx:(.text._ZN5boost9iostreams6detail9close_allINS0_22basic_bzip2_compressorISaIcEEENS1_16linked_streambufIcSt11char_traitsIcEEEEEvRT_RT0_[_ZN5boost9iostreams6detail9close_allINS0_22basic_bzip2_compressorISaIcEEENS1_16linked_streambufIcSt11char_traitsIcEEEEEvRT_RT0_]+0x49): undefined reference to `boost::iostreams::detail::bzip2_base::end(bool)'
/usr/bin/ld: CMakeFiles/FileSink.dir/FileSink.cxx.o: in function `nestdaq::Compressor::CreateFilter(nestdaq::Compressor::Format, int)':
FileSink.cxx:(.text._ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi[_ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi]+0x692): undefined reference to `boost::iostreams::detail::bzip2_base::bzip2_base(boost::iostreams::bzip2_params const&)'
/usr/bin/ld: FileSink.cxx:(.text._ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi[_ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi]+0xaa2): undefined reference to `boost::iostreams::detail::bzip2_base::end(bool, std::nothrow_t)'
/usr/bin/ld: FileSink.cxx:(.text._ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi[_ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi]+0xaaa): undefined reference to `boost::iostreams::detail::bzip2_base::~bzip2_base()'
/usr/bin/ld: FileSink.cxx:(.text._ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi[_ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi]+0xaec): undefined reference to `boost::iostreams::detail::bzip2_base::end(bool, std::nothrow_t)'
/usr/bin/ld: FileSink.cxx:(.text._ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi[_ZN7nestdaq10Compressor12CreateFilterENS0_6FormatEi]+0xaf4): undefined reference to `boost::iostreams::detail::bzip2_base::~bzip2_base()'
/usr/bin/ld: warning: creating DT_TEXTREL in a PIE
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[2]: *** [CMakeFiles/FileSink.dir/build.make:131: FileSink] Error 1
make[1]: *** [CMakeFiles/Makefile2:205: CMakeFiles/FileSink.dir/all] Error 2
make: *** [Makefile:136: all] Error 2

boot のコンパイル時に bzip2 が no になっていたのが原因のようだ。

    - zlib                     : yes (cached) [5]
    - bzip2                    : no  (cached) [5]
    - lzma                     : no  (cached) [5]
    - zstd                     : yes (cached) [5]
    - lzma                     : no  (cached) [5]
    - has_lzma_cputhreads builds : no  (cached) [9]

sudo apt install libbz2-dev としてから、/home/nestdaq/nestdaq/src/boost ディレクトリを全部削除してから、コンパイルし直した。そうしないと、bzip2 : yes (cached) [5] とならない（他に良い方法あるんだろうか？）。boost をコンパイルし直したあと、ZeroMQ, fmtlib, FairLogger, FairMQ, hiredis, redis-plus-plus, nestdaq, redisinsight を make し直す必要はないようだ。

./stat_device.sh Scaler 時のエラー。

nestdaq@a04:~/run$ ./start_device.sh Scaler                                                     │
BINDIR             = /home/nestdaq/nestdaq/bin                                                  │
PLUGIN_LIBDIR      = /home/nestdaq/nestdaq/lib                                                  │
PLUGIN_SEARCH_PATH =  -S '</home/nestdaq/nestdaq/lib'                                           │
DAQSERVICE_PLUGIN  =  -P daq_service                                                            │
METRICS_PLUGIN     =  -P metrics                                                                │
CONFIG_PLUGIN      =  -P parameter_config                                                       │
DAQSERVICE_URI     =  --registry-uri tcp://127.0.0.1:6379/0                                     │
METRICS_URI        =  --metrics-uri tcp://127.0.0.1:6379/1                                      │
CONFIG_URI         =  --parameter-config-uri tcp://127.0.0.1:6379/2                             │
DQM_URI            =  --dqm-uri tcp://127.0.0.1:6379/3                                          │
/home/nestdaq/nestdaq/bin/Scaler: symbol lookup error: /home/nestdaq/nestdaq/bin/Scaler: undefin│
ed symbol: _ZN7UH1Book4FillEd

なんかライブラリのリンクとかを疑ってみたが、ldd $HOME/nestdaq/bin/Scaler ではちゃんとリンクされていた。ただ、objdump -T libuhbook.so とすると、_ZN7UH1Book4FillEdd, _ZN7UH1Book4FillEddd というのはあったが、_ZN7UH1Book4FillEd はなかった。関数がちゃんと読めていないのかと思って、多重定義関数のソースコードの引数などを修正する必要があるかと思ったが、そもそも make install していなかったことに気づいた。前にインストールしたライブラリの関数の名前が残っていてリンクのエラーっぽいエラーメッセージになっていた。はまりやすいところなので注意。

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